Наведение порядка в формикарии является неотъемлемой частью ухода за колонией. Как правило жилые камеры формикария почистить практически невозможно, но чистка арены - задача вполне выполнимая и важная.

При проектировании арены важно учитывать необходимость периодической уборки. Необходимо продумать арену таким образом, чтоб вся ее площадь была доступна для быстрого обслуживания, которое не вызовет проблем у вас и ваших питомцев.
Периодически с арены необходимо удалять весь скопившийся мусор (останки насекомых, вскрытые коконы и др.).
Крупный мусор можно собрать пинцетом. Для мелкого хорошо подойдет эксгаустер или USB-пылесос для клавиатур.
Необходимо удалять весь мусор с полосы антипобега, и при необходимости обновлять его. Чистку желательно выполнять во время нраименьшей активности муравьев, это избавит их от лишнего стресса.

При большой численности муравьев чистка арены может доставить хлопот. Для чистки арены можно использовать эксгаустер (см. приложение), но вместо муравьев засасывать мусор. Если арену нужно почистить капитально, то можно попытаться прогнать муравьев в формикарий, заткнуть трубку/вход ваткой и спокойно убраться. Но со многими видами это затруднительно – например, рыжие лесные муравьи вместо того чтоб испугаться и убежать, в лутшем случае встанут в стойку и начнут обстреливать мирмикипера кислотой, в худшем - побегут все защищать свой муравейник. Поэтому при проектировании арены необходимо тщательно продумать возможность ее чистки, которая не займет много времени и не покалечит муравьев. Идеальным вариантом для маленьких семей, является сменная арена, когда к формикарию подключается новая (чистая) арена, а старая путем затруднения доступа к ней муравьев (переподключение старой арены через новую. или к такому выходному отверстию формикария которым муравьи редко пользуются) постепенно выводится с эксплуатации. Для таких как рыжие лесные муравьи чистку или смену арены лутше приурочить к периоду их зимовки, но сама конструкция такой арены должна предусматривать возможность установки сменных модулей-кормушек которые легко изьять не тревожа муравьев, заменить или почистить.